A 4 Kms. de Burgos. El rey Enrique III cedió su palacio destinado a jornadas de caza con el proyecto de cederlo a los monjes del cister.
En 1332 el rey Juan II su hijo, donó esta residencia finalmente a los monjes del cister con advocación a San Francisco de Asís. En 1442 el rey Juan II de Castilla y León la donó a los monjes cartujos cambiado el nombre al de Santa María de Miraflores, aunque en realidad casi toda la obra es exclusiva de su hija la reina Isabel la Católica.
Estuvo habitado por esta orden excepto en tiempos de la guerra de independencia y después con la desamortización.
Impresionante mausoleo del rey Juan -II- y su esposa Isabel de Portugal. Actualmente está ocupada por una comunidad de Cartujos.